[PEHDOM]

если при етом он тебе ничего не платит то никаких проблем не должно быть, ведь никакого дохода ты от етого не получаешь. Квартира твоя и твое личное дело кого туда пускать проживать, никого другого ето не касаеться. От того кто там живет никаких проблем быть не должно(естественно при нормальном поведении последнего)

если всетаки он тебе платит (типа аренда) то при единичном случае (у тебя только одна квартира , а не десяток по всей Москве) тоже никаких проблем не должно быть, особенно если оплата идет наличкой (в случае чего морду кирпичем мой друг/родственик пустил пожить ничего мне не платит) очень тружно доказать факт оплаты.
Кроме того такой мелочевкой налоговая просто не занимаеться. Честно не знаю как в Русском законодавстве, но в Украинском если твой неучтенный доход не превышает определённой суммы в год (по моему около 4000 $) то даже не нужно заполнять налоговую декларацию.