Наберите в справочной системе Windows слово convert или ntfs (преобразование жесткого диска или раздела в формат NTFS) - и да будет Вам счастье.
В Windows 2000 и выше - эта возможность точно есть.
Преобразование можно выполнить даже когда на диске уже имеются данные, ничего удалять или переносить не нужно. Только позаботтесь о бесперебойном питании компьютера во время процедуры.