Есть прога создающая секретный раздел на флешке - U-Storage из пакета USB Flash Drive Tools (текущая версия 2.9). Алгоритм работы такой: создается скрытый раздел на флешке (невидим из дифолтовых дров винды), заинсталив спец-дрова, юзер получает полноценный доступ к секретному разделу (как к обыкновенной флешке), введя пароль доступа.
U-Storage 2.9
http://www.xonixwatch.com/en/Download/ustor29_prog.zip
работает отлично. Пользователь, установив спецдрова получает доступ либо к основному разделу (Public), либо к скрытому (Secure) после ввода пароля. Со стандартными дровами доступен только основной раздел.