Имеет смысл проверить, какие программы попали в меню автозапуска.
Возможно, что грузится что-то такое, что занимает все ресурсы.
Я пользуюсь программой Starter
http://CodeStuff.cjb.net
Удалите с ее помощью все лишнее и перезапустите компьютер.
Вторая возможная причина - неисправность жесткого диска,
в этом случае диск плохо находит дорожки и "тормозит",
обычно при этом из него слышны равномерные щелкчки.