К вышесказанному хочу порекомендовать тулзу
USB Safely Remove (
тут читать и качать). Помогает остановить у стройство даже если оно фактически занято, заодно и покажет - чем же оно занято. Это даже не альтернатива стандартному "Безопасному извлечению устройства" - а хорошая замена, потому как на несколько порядков удобнее и функциональнее. ИМХО.